故事其实不冗杂，一个极富音乐才调的男生叶湘伦（别名小伦，周杰伦饰）转学到一所新的中学。转学生到了新的学校，心里老是有一点惶恐和不安的，更何况他仍是一个内向少言的羞怯少年。合理他带着猎奇渐渐承受那个全新的情况之时，他碰见了一个秀美可人的少女细雨（桂纶镁饰），两人初见是在钢琴房里，傻小子愣头愣脑地闯进琴房，轰动了正在抚琴的姑娘，他是为琴房里传出一段令人着迷的琴声所吸引，从小学琴的他竟然没有听过那首悦耳的曲子，于是他问女孩那是什么曲子，女孩奥秘地一笑“那是一个不克不及说的奥秘。
从此他便迷上了阿谁抚琴女孩，迷上了那首不出名的乐曲。
叶湘伦为了给女孩找一本很珍贵的琴谱，竟然以重生的身份向学校出名的钢琴王子挑战，成果，那位学长输得很没体面，当寡把那本琴谱给了他。从此，那个羞怯的男生也博得了很多女生的芳心，谁会不为一个有才调又彬彬有礼的男生心动呢？
当然，小伦和细雨的豪情也越来越好。
他会用单车送活泼心爱的她回家，两小我也经常会一路在琴房抚琴。有一次，细雨弹起了她第一次碰见小伦时弹的那首曲子，细雨告诉小伦，万万不要在旧琴房弹那首曲子！小伦也伤感地说，等结业仪式举行完，学校的旧琴房马上就要拆了。他会在结业仪式上，为细雨吹奏一首曲子。
有一天，她以至把他领到她家里的天台上，暮霭中，面临垂垂西下的落日和滚滚动逝的江流，他们有了人生中的初吻。
细雨有哮喘的弊端，小伦就四处探听吃什么对医治哮喘有搀扶帮助，为了那个，他以至容许和音乐狂老爸跳舞，成果家里刚刚买来的一堆苹果被小伦带到学校，他要让细雨每天吃一个。
可女孩却越来越奥秘，她几乎没有什么伴侣，如今，以至经常不来上课，小伦的苹果最多的时候攒了15个，那就代表细雨15天没有到学校来上课。
他去找细雨，可细雨的妈妈说她病了，在家歇息。比及第二次他去找细雨，细雨的妈妈让他进了门，说细雨正在歇息，可小伦进入细雨的房间，才发现房内一无所有，小伦发现了一张素描绘像，而画像上的人恰是他本身。
同时，他还在细雨的房间里发现了一张泛黄的照片，照片上的人，一个是细雨，一个是小伦的爸爸。
迷惘、骇怪、猎奇立时占据了他的心头，让他心烦意乱。他回到家，向爸爸问起了那张照片的来历。
本来，细雨是二十年前爸爸的学生，也是音乐班的，主修钢琴，十分有才调。
有一天，细雨在琴房练琴，偶尔间在钢琴底下发现了一本很陈旧的琴谱，她照着琴谱弹了起来，在美好的琴声中，琴房的墙壁起头变得班驳，屋子里此外家具也飞快地不竭变更着位置，本来，那本奥秘的琴谱带着细雨穿越时空，来到了二十年后，也就是一九九九年，仍是那个琴房，细雨弹完一曲，小伦从琴房外走进来。
因为小伦在结业仪式上抚琴的时候戴着同班喜欢小伦的女生给小伦的幸运手链，细雨和小伦产生了误会……
与此同时，那个一在旧琴房弹起那本名叫“奥秘”的琴谱上的乐曲就能穿越时空的的“奥秘”让细雨陷入了猜疑，因为在将来的一九九九年，除了小伦，此外人都看不到她，另一方面，她说本身可以穿越时空的反常举行也遭到同窗们的嘲笑和不睬解，只要小伦的爸爸——叶教师理解她，安抚她。
因为各人都认为细雨是异想天开，精神呈现了问题，妈妈便让她退了学，从此她便待在家里。但叶教师没有放弃她，他以至亲身到细雨家，邀请她回学校参与结业仪式，于是，就有了小伦在细雨家发现的两人的合影。
小伦茅塞顿开，以往和细雨在一路的一幕幕情况，一时间全数涌上他的心头，他发疯般地冲向学校里的那间旧琴房，掉臂琴房正在拆迁的危险，顺着楼外的脚手架，砸破琴房被密封的玻璃爬上了那间旧琴房，破裂的玻璃把他的手臂划伤了。
但他底子顾不上伤痛，飞快跑到钢琴前，发疯一样地弹着那首细雨弹的曲子。窗外，拆迁的铲斗车也起头一铲斗、一铲斗地拆楼，楼体起头颤动，可小伦仍是像什么都没有发作一样地弹着琴，最初，用于拆迁的庞大的钢球向正在抚琴小伦的座来……。