她的前夫成了户主，为什么关系那里写的是“妻子”呢？

那个是民警操做失误，应该是“非亲属”。将户口本拿到派出所往阐明情状，民警会立即纠正的。

你们之前打点分户手续时已经提交相关证明素材了。你只需要到派出所阐明情状，拿出户口本（婚姻情况一栏为离婚字样），民警就会为你们纠错、从头打一个户口本的。