东汉初年，中心更高的官职是三公，就是司徒（由丞相改称，管民政，权利比丞相小得多）、司空（由御史医生改称，不再管监察，而是改管严重水土工程）和太尉（管军事)。太尉一职应改称司马，因刘秀曾任刘玄的“行大司马事”，为避忌而未改。三公的职位虽高，徒有虚名，并没有实权。权利集中于间接听命于皇帝的尚书台。东汉初年，进一步扩展尚书台机构，设尚书令一人，领取千石（西汉时为六百石）的工资待遇，为尚书台的主管长官；另设尚书仆射一人，秩六百石，为尚书令之佐；又设左、右丞各一人，秩四百石，为令、仆之佐。此时恢复了西汉时设置过的三套监察机构，并且有所加强。
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