在西班牙人统治中南美洲之前，那种颜料普遍见于玛雅人的壁画，陶器和雕像中，履历了神异式微，不外在古巴地域，有利用笔录，它在奇成伊札(Chichen Itza)地域的寺院中被从头发现。玛雅蓝最为人称道的是它超强的耐侵蚀性。滚水、高浓度的酸或碱和各类有机溶剂都无法毁坏其构造，经年累月的气温改变和湿润的空气也无法使它褪色。
最后，人们认为它是一种纯的矿物量，后来有人提出，它是无色的凹凸棒石黏土混合了一种来自动物的靛青成分构成的，那个揣测颠末研究者的X射线衍射尝试得到了证明。通过电子显微镜看察玛雅蓝的原子摆列，墨西哥大学的素材科学家米格尔若泽-亚卡曼(Miguel Jos-Yacamn)发现了板状、好像笼子般的构造，其间正好能够“躲进”有机颜料分子，庇护其不受侵蚀，那可能就是玛雅蓝历经千年仍然鲜明的原因。
它或许还能够称为世界上最早的纳米素材之一，靛青自己的蓝色看上往其实不非常亮堂，但纳米级此外矿土颗粒填补了那一缺憾，因为特殊小的颗粒正好反射了光谱中的一段蓝光。[玛雅蓝的微看构造与3A、4A、5A分子筛接近，孔径在3埃摆布，也有人称之为埃矿晶、埃瓷、埃晶。
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