《心灵部屋》导演阿亮（加濑亮饰），与恋人洋子（藤谷文子饰）一起来到东京。二人找到了在东京过着单身生活的高中同学明美（伊藤步饰），并暂时在明美的家中借宿几日，许久未见的三个人，对这次再会都显得高兴不已。阿亮与洋子为了能早点从明美的家中搬出来独立生活，他们开始到处找零工活，希望能打工挣钱。
两人偶然在一家小店里接受了包装工作的测试，但结果只有阿亮一个人合格了。失败了的洋子，突然对什么事都做不好、笨拙无用的自己感到有些自责。继续借宿在明美家中的两个人，终于等来了阿亮的电影上映的日子。俩人得意扬扬地来到了通常上映色情电影的小影院，影片放映结束后，现场许多观众大声欢呼，看着满面欢喜的阿亮，洋子觉得这里没有容得下自己的地方。
第二天早上，阿亮、明美他们都出去工作了，洋子最后一个起床，她突然发现自己的身体有些异样。当洋子对着镜子查看自己的时候，她发现自己的肚子那里变成了一个大洞……《东京》《东京御宅》，他（香川照之饰），一直待着家里过日子，站着吃饭，在厕所里睡着，坐在堆积如山的书中看书。
这个男人，从来不踏出家门一步，这样的闭居生活已经有十年了。每个星期六，他都会定一个比萨。这一天，他偶然看到了，上门来送比萨的少女身穿吊袜带的腿，于是，下意识地抬起头来，看着这位美丽的少女（苍井优饰）。那一刻，时间仿佛停了下来，二人相互望着对方，突然，耳旁响起了一阵轰鸣声。
屋里的东西开始四处散落，少女像断了气一样地倒在了男子面前。男子一动不动地凝视着好象没有了呼吸的少女，意外发现她的手臂和脚腕上有奇怪的按钮。他试着按了一下写有“comma”的按钮，于是，少女立即像什么都没发生过一样地醒了过来。少女环视了一下男子的家，留下一句“这里真完美”，便离开了。
这一次相遇，男子心中的某种东西开始变得摇摆不定。可是，少女辞了工作，永远不会再出现在自己的家里。“想要见到她的办法只有一个”，终于，男子出了家门，朝着少女居住的那条街跑去……《梅尔多》，喧嚣的大都市，突然有一个神秘男子从下水道中爬了出来，在大街上奔驰。
这个叫梅尔多（德尼·拉旺饰）的人，用独特的走路方式——将手放在心脏上，冲向了银座大街，骚扰着周围的路人。突如其来的神秘男子，成为各大媒体争相报道的对象，人们还给他起了一个外号——“下水道怪人”，从此，梅尔多成了东京人热论的话题人物。某天，梅尔多突然出现在人流众多的涩谷人行天桥上，一边大喊着莫名其妙的语言，一边朝着马路上扔了一个手榴弹，巨大的轰鸣声结束后，繁华的街道变成了一片血红的世界，梅尔多立即被拘捕了下来。
世界各国发来了关于梅尔多的情报，据说，全世界只有三个人能听得懂梅尔多的特殊语言，法国律师沃兰多（让-弗朗索瓦·巴尔梅饰）为此事来到了日本。审判开始了。在被问到为什么要干那样的事时，梅尔多很无所谓地回答说“因为不喜欢人类”。连日来，关于审判的新闻，已经在日本闹得沸沸扬扬，要求判处梅尔多死刑的声讨声，以及将梅尔多当作领袖人物一般疯狂崇拜的声援声，互不相让。
接着，判决书下来了……。