第1集
宋慈屡破奇案，成为提点刑狱司。慈带同两位怀有身孕的妻子到湖南上任，途中破了一宗命案，竟令两位妻子葬身火海。慈伤痛，辞官归隐，途中遇上暴风雨。县捕快展杰在沙滩发现奄奄一息的慈，将他运到邹子龙负责看守的义庄。替死人化妆的纸扎铺太子女阮玉珠与龙返义庄，见慈拿着菜刀走向一怀孕女尸，以为慈对女尸有不轨企图，原来慈只为女尸接生，救下了女尸腹中活着的胎儿。
慈为救被米袋压伤的小朋友而推跌珠，令珠为母亲买燕窝治病的钱被抢走。慈见珠母病重，遂留下来帮手打理纸扎铺生意。慈到妓院收数，见一妓女与嫖客吵架，众人以为是狐狸精作怪。凤与其母遂找龙扮狐狸精上身，以取得在妓院驱妖的生意。事后凤作弄龙，龙气极带慈去揭开客人发狂真相，龙与凤更双双中毒。
慈与珠为女尸秀化妆，慈推断出秀不是自杀且怀有身孕，但其父母不信。
第2集
珠到衙门欲击鼓为女尸伸冤，为秀父温员外阻止，纠缠间惊动杰，温反指珠意图勒索。珠、慈与温对簿公堂，慈举出疑点，统统被驳回，慈突然头痛，累珠及他被打。慈临急提出要剖秀尸，果证实秀有身孕，并举证说不是自杀而是被谋杀。
杰等捕快四出找寻秀所失的玉佩，竟发现龙曾将秀玉佩押给当铺，再加上樵夫对龙不利的证据，龙成为杀秀的嫌疑犯。龙提出不在场证据，说曾见凤，凤却说未见过。杰四出找寻龙曾碰见的美貌拿扇少女，杰终找到阮玉宝，证明樵夫讲大话，龙无罪释放。宝母何淑兰与珠在衙门前争执。
第3集
龙向慈讲出珠与宝关系，珠指其母被兰陷害。凤到温府打斋，见温夫人面青唇白说：「救我！」，温砌词说妻忆女成狂。杰请慈再查秀案，却得知温员外私取秀尸，慈等要温员外交还尸体。慈搬出「验尸法则」，成功取回秀尸。慈从秀背上找到伤痕，再得悉秀本不是姓温，决到温府一趟。
慈在温员外书房中找到与秀伤痕吻合的武器，杀秀的真凶终于被捕。珠与人争执，慈指珠不应摆出凶恶样，更以自己惨事勉励珠。慈怕珠对自己殷勤，答应捕头展坚之邀，做其忤作。宝知义庄多异乡客尸，假仁假义说要搞斋宴起义冢，得乡绅赞扬。慈突晕倒，诊断出脑有瘀血，需要梅花神针救之，村民筹钱给慈上路找神针传人郡马爷夏侯国栋，栋亦束手无策。
珠知粥店老板陈明乃神针传人，求明救慈，终打动他。
第4集
慈终醒来，明劝慈不要放弃生命。栋得知慈无碍，猜到谁懂得神针。栋揭穿明本是太医，因落药太重令骁骑大将军死亡而成逃犯。慈决为明洗冤，偷偷开棺验尸，少将军马伯豪与栋突出现，慈与龙被捉。
慈被逼公开身分，众不信，豪答允给慈五日时间让他的验尸守则手稿送到衙门作印证。慈奇怪栋为何阻止翻案，众感事件另有别情。杰与坚在驿站遇上送手稿兵士，抢去手稿赶到衙门。明正要为慈落针医病时，栋率众到狱中捉明往处斩，幸手稿至，慈冒头痛写字以证身分。紫霞郡主至，坚称慈乃假冒，幸送稿兵士原来是十皇爷，慈身分得到证实，明终可翻案，但明突然认罪。
第5集
慈在验将军尸时发现有芒钉留在尸身，推断有人插赃嫁祸明，真凶终绳之以法。就在处斩时，霞带同紫龙袍往救之，狂风吹起龙袍，真凶最后难逃天谴。慈留在松山县担任提点刑狱司，珠为替慈取回其妻的玉佩而与宝冲突，凤更间接令宝面部受伤。宝告上衙门，凤被逼入狱三日候判。
慈指自己心如止水，叫珠不必对自己太好。宝着龙引见慈，并归还玉佩，慈代凤向宝求情。公堂上，宝要求凤赔偿一百两。斋宴上凤提出以卖头发筹赔偿金，慈带头捐钱及富翁关万福支持，凤终可赔偿宝。关府发生侍婢跌落井命案，慈调查证实关夫人诬蔑侍婢偷珠钗，侍婢看不开寻死。
第6集
杰母吕氏欲撮合珠与杰，令杰不自然。妓女如梦替凤解围，令凤不被嫖客留难，杰看在眼里，觉梦有情有义。宝落选秀女选举，龙以为宝欲跳崖轻生，连忙阻止。宝叫龙拜慈为师，学习验尸技巧。龙在众人前拜慈为师，慈初拒，后要求如有命案龙就要在慈面前验尸。
龙第一次验尸不但迟到，更破坏现场证据及错漏百出，慈拒绝收龙为徒，宝得知即嫌弃龙。宝遇福，福被其天使面孔吸引。吕向龙打探珠的过去，慈在旁大赞珠，龙质问慈为何要撮合杰与珠。凤欲开食店但苦无资本，得梦相助。宝为钱决嫁给福为平妻，更在龙面前撒谎说为父还债，龙苦劝无效更被打伤。
第7集
龙在凤前自责未能帮宝，凤以自己儿时惨况激励龙。梦见两女孩行乞，更信她们被拐子佬利用，梦将女孩事告知众捕快，众笑梦愚蠢，惟独杰相信，杰知梦身世非常同情，二人互生好感。吕与娴欲撮合杰与珠，二人皆感不自然。珠得知杰与梦交往，决为二人掩饰。
慈在珠前赞杰，珠故意赞同 激慈。珠、梦跟踪女孩，被拐子佬捉个正着，二女被绑架，匪徒向国色天香楼勒索，慈、杰等大为紧张，布下天罗地网活捉绑匪，绑匪逃脱并捉了凤。龙错手打死绑匪，梦、珠下落不明，众寻不获，慈不吃不休意图从匪尸找出二女藏身点，终找到线索。
第8集
一商人失踪，慈与众捕快推断他已死，但遍寻尸体不获。龙从生炉火悟出寻尸方法，珠、凤在慈面前大赞龙。原来慈有心让龙大显身手，龙便可拜自己为师，二人终成为师徒。凤对珠说自己会与属龙的男子配成一对，后得知龙也属龙，芳心暗喜。龙不小心将重要证物绳结扔掉，彷徨间见珠奋不顾身为自己找绳结，感动。
慈要龙和珠重组案件，当龙抱着珠竟有异样感觉。杰与梦逛街时，梦遭嫖客调戏，杰看不过眼与嫖客大打出手，坚知道二人交往，大力反对。杰决要为梦赎身，但苦无银。龙向珠表白，珠诧异并以为龙开玩笑。
第9集
珠向凤提起龙向自己表白，并表示会尝试与龙发展。
慈要龙穿上特厚棉衣试跌落楼以验证死者死因，龙跌伤，珠细心照顾，慈、凤感不是味儿。杰与梦欲私奔，被鸨母傲雪姨和坚阻止，梦只好叹句「有缘无份」。珠替龙补习验尸个案外，更要龙储钱为二人未来打算。梦曾借一百两给一客人莫振声做生意，声赚大钱后要为梦赎身，梦无奈，只想杰为自己赎身。
慈与珠同帮助乞儿婆，婆称二人有缘并送各一蝴蝶结。杰单思梦成病，吕说出梦会跟声离开松山县。杰往找梦，梦说从未爱过杰，后经不起杰哀求，梦坦言不想毁杰前程。晚，梦一觉醒来，竟发现声死在身旁。
第10集
梦作供时，坚处处针对，杰代梦反驳坚，坚更当众说怀疑杰是凶手，幸慈、龙作为杰人证。
曾与声争梦的袁日川，指坚为子公报私仇，坚震怒。凤要看飞星，龙邀珠同行，但珠反对，龙一人看飞星遇凤。珠得知龙为看星未能完成验尸报告，当街骂他。龙吃凤所煮的燕窝粥后肚泻，珠认为龙讲大话，凤为证龙没有说谎而吃下粥，果真肚泻。明设法医好杰怕血腥的死症，终令杰克服困难。
珠不见蝴蝶结，大为紧张，慈看在眼里，竟将蝴蝶结送给龙。明发现声送给凤与珠的是假燕窝，通知慈。龙推断声的血混合动物血，而坚也找到凶器，凶器竟由梦的丝巾包着。
第11集
梦被收监待审，慈终证实声身上的血为猪血混人血，凤说出声被杀当晚粥铺后巷少了猪血，众人遂在后巷找寻证据，果然，在墙上找到血戒指印，慈终查出谁是凶手。
凶手见衙差找寻自己，慌忙逃脱，杰不怕血腥生擒凶手。经此案后，坚与杰的关系似有改善。龙难得放假，竟跑到赌坊而忘记修发剃面，凤请缨帮龙，二人独对时，龙竟有心动感觉，问凤他应否与珠一起，凤默然赶走龙，其后龙还凤耳环，情不自禁拥着凤。珠与慈谈起与龙一起仿如凑仔，慈安慰她。
慈验尸时，因心情好跟龙开了一个玩笑。苦力朱顺堕崖而死，众推断应从其美艳妻子李玉贞着手调查。
第12集
慈巧计终找到杀顺的凶手，就是其妻的奸夫。龙慨叹顺与贞不相衬，结合才引致这宗情杀案。龙偷偷以字条约凤见面，字条竟一先一后被慈及珠看过。
凤与龙见面，凤坚持不可有负珠，宁与龙一刀两断，对话被慈、珠听见。珠质问龙，龙坦言喜欢了凤，珠往找凤，竟表示没有因她夺了龙而生气，反却松一口气。龙与凤终名正言顺成为一对。媒人婆为珠做媒，竟当面指珠不嫁傻子便无人可嫁，珠与她大吵一顿，并怨自己为何一定要嫁，慈见状好言相慰。
龙终于通过仵作考核试，与此同时，已嫁入关家的宝重返松山县更遇上龙，更送他一平安符，此举令龙心如鹿撞。
第13集
宝在观音庙遇关夫人李氏，遭李奚落，龙看不过眼代宝出头，李反说宝勾三搭四，宝假装默默承受，龙多谢宝当日提点自己拜师。梦往找福请他捐钱建慈幼局，福一口答应借出大屋，梦与宝往看大屋，遇上工匠丧命，慈、龙往验尸，龙得以在宝面前表现自己。
方州爆发瘟疫，慈奉命与明前往调查，慈一走即发生命案，福死，龙往验尸，认为福死于马上风，但李坚持要等慈回来再验尸。慈、明到方州，与经略使高云轩大人入疫区，终找出引发瘟疫原因，慈与高惺惺相惜。杰发现宝丫环曾买波斯香料「依兰依兰」与「到手香」，觉宝可疑。
第14集
龙隐瞒凤曾见宝，凤问龙为何欺骗自己。慈在研究香料时，珠突至，并受香料影响质问慈为何不肯承认喜欢自己，二人亲吻。杰与明至，竟说弄错了香料，明说二人姻缘乃天意安排。慈利用蝴蝶结及玉佩测试二人的缘份。珠见宝与一男子拥抱，宝一时情急弄伤珠脸。
慈欲向珠表白时，珠失血过多晕倒，慈抱珠跑了四条街找明医治。明说珠会毁容，慈答应娶珠，珠认为慈同情自己，拒绝。慈怀疑宝与福的弟弟关万安有染，安排凤、梦试探二人。慈为珠上山涧找药治脸伤，不慎跌落山洞及被蛇咬，珠紧张，原来一切乃明安排试二人感情。
第15集
宝提出分家，李大力反对，其后李验出有喜，宝与安觉得分家一事更难实行，宝心生一计。
宝约龙把酒谈心，凤从香口中得悉，感不是味儿。未几，龙饮醉晕倒。另边厢，李在观音庙被烧死，凤路过庙时，见一熟悉背影后即见庙大火。凤说见过宝在庙出现，但龙则力证宝与自己一起喝醉酒。安见宝与龙谈得投契，感妒忌。慈以狗做实验，试出波斯香料加上「益多散」会令人死亡，慈认为宝杀夫嫌疑大。
安救险被调戏的梦，梦请安回家吃饭，并说要燃点宝给的香料及她送来的牛，安以为宝加害自己，往找宝理论。二人奸计终揭破。
第16集
龙对慈、杰等瞒着自己查宝感气愤，发誓不出人头地不回来。兰与珠父阮丞昌请娴、珠救宝，不果，兰发难。
宝终处斩，娴每晚梦见宝，被吓至吐血。珠与慈决定成亲，疯癫的兰诅咒二人会死。明往医娴时见兰来到，兰自言自语说送礼给娴。纸扎铺大火，两神秘人抬出明与娴，明死，娴用最后一口气送鸳鸯枕给珠。慈替明、娴验尸，发现明有骨折及曾被鞭尸，娴则没有，指凶手目标是明。
珠在铺中找到两副棺材，认为是兰所为。珠遇见兰，欲带她到衙门，二人追逐至郊外，珠失去兰踪影，巧遇孙婆婆，孙拉她下山而受伤，孙更替珠摸骨，指她会有灾劫。
第17集
兰死，珠顿成为嫌疑犯。慈为兰验尸时发现她死前曾被奸污。高到松山县，向慈引见龙，龙被高提拔为司理，龙替明验尸伤时发现尸身被涂上榉树汁，做成被打的伤痕，慈再三表明没有涂树汁，以洗去珠杀人嫌疑，高提议慈不用处理这宗命案。
珠向慈说出曾遇孙，但二人往找她时，却不见其踪影。龙一改过往性格变得冷漠，更冷指杰没有替珠验打斗伤痕，对凤亦不讲往日情。龙带人到凤家，找出珠在孙家所穿的衣服，验证下发现血迹，珠被收监。慈推测整件事有幕后人策划，其后慈在纸扎铺调查时遇刺客，手部受伤……
第18集
慈往见霞并告之明已死，霞淡然说出到松山县只为栋的死忌。
慈约见龙，指明三人之死皆由龙离开后发生，更说龙是敌人的棋子，龙心内不舒服，反驳慈只想打击他的自信心。梦义卖福禄寿饼为孤儿筹款，坚见她的热心终放下成见。七叔在凤粥铺找香辟邪，说见过兰死前与珠在紫竹林出现，凤通知慈。此时，高的手下丁副将收到消息，联同坚等往牛头山找七叔，慈却比丁早找到七叔尸体。
杰在紫竹林搜索时遇上珠，又发现珠的削竹刀及竹筒。公堂上龙指慈帮珠杀兰，更指他杀害七叔，幸慈有豪作不在场证人，珠旋即被收监。
第19集
慈、杰偷入停尸间替明验尸，被龙捉个正着，连累杰被停职。凤问龙为何指证珠是凶手，龙表白最想与凤分享现时成就时，竟迷晕她与自己成其好事。
珠在狱中受尽酷刑，仍不肯承认杀兰。慈说若龙可替珠翻案，自己便退出官场。龙再验明尸后声称有新证据，要求高代为引见霞。龙以此跟霞交易，龙要做提点刑狱司，霞则要慈颈上人头。慈应龙之约，龙声称与慈并肩作战，二人终找到沾有毒液的银针及装有毒液的竹筒。公堂上，龙指杀七叔的凶器有慈指模，慈竟早料他有此一着。
龙恐吓凤如不与自己合作出卖珠，她与母香姑便有危险，凤犹豫。
第20集
凤替十皇爷传达口讯约慈在渡头见面。另一边厢，黑衣人血洗监牢带走珠，将珠带到渡头并把剑塞给慈，时高至，说慈劫狱杀人。公堂上，慈找来凤证明十皇爷约见自己，但凤反口，慈、珠对凤的变脸感心痛，二人被判处斩。
慈与珠欲在狱中拜堂，被霞阻止。处斩当日，十皇爷与豪劫法场，不果。当龙献上慈人头给霞之后，即传来凡与慈有接触的皆会中毒。霞与龙双双中毒，此时慈、珠出现……。霞在临吃解药前忽然发难，以刀刺慈，珠为救慈而挡了一刀，生命危在旦夕，慈以为自己天煞孤星之命会克死珠，毅然离开，莫非慈真的要孤独终老？
法医宋慈分集介绍第1集 宋慈屡破奇案，成为提点刑狱司。慈带同两位怀有身孕的妻子到湖南上任，途中破了一宗命案，竟令两位妻子葬身火海。慈伤痛，辞官归隐，途中遇上暴风雨。县捕快展杰在沙滩发现奄奄一息的慈，将他运到邹子龙负责看守的义庄。替死人化妆的纸扎铺太子女阮玉珠与龙返义庄，见慈拿着菜刀走向一怀孕女尸，以为慈对女尸有不轨企图，原来慈只为女尸接生，救下了女尸腹中活着的胎儿。
慈为救被米袋压伤的小朋友而推跌珠，令珠为母亲买燕窝治病的钱被抢走。慈见珠母病重，遂留下来帮手打理纸扎铺生意。慈到妓院收数，见一妓女与嫖客吵架，众人以为是狐狸精作怪。凤与其母遂找龙扮狐狸精上身，以取得在妓院驱妖的生意。事后凤作弄龙，龙气极带慈去揭开客人发狂真相，龙与凤更双双中毒。
慈与珠为女尸秀化妆，慈推断出秀不是自杀且怀有身孕，但其父母不信。
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法医宋慈分集介绍第2集 珠到衙门欲击鼓为女尸伸冤，为秀父温员外阻止，纠缠间惊动杰，温反指珠意图勒索。
珠、慈与温对簿公堂，慈举出疑点，统统被驳回，慈突然头痛，累珠及他被打。慈临急提出要剖秀尸，果证实秀有身孕，并举证说不是自杀而是被谋杀。杰等捕快四出找寻秀所失的玉佩，竟发现龙曾将秀玉佩押给当铺，再加上樵夫对龙不利的证据，龙成为杀秀的嫌疑犯。龙提出不在场证据，说曾见凤，凤却说未见过。
杰四出找寻龙曾碰见的美貌拿扇少女，杰终找到阮玉宝，证明樵夫讲大话，龙无罪释放。宝母何淑兰与珠在衙门前争执。
法医宋慈分集介绍第3集 龙向慈讲出珠与宝关系，珠指其母被兰陷害。
凤到温府打斋，见温夫人面青唇白说：「救我！」，温砌词说妻忆女成狂。杰请慈再查秀案，却得知温员外私取秀尸，慈等要温员外交还尸体。慈搬出「验尸法则」，成功取回秀尸。慈从秀背上找到伤痕，再得悉秀本不是姓温，决到温府一趟。慈在温员外书房中找到与秀伤痕吻合的武器，杀秀的真凶终于被捕。
珠与人争执，慈指珠不应摆出凶恶样，更以自己惨事勉励珠。慈怕珠对自己殷勤，答应捕头展坚之邀，做其忤作。宝知义庄多异乡客尸，假仁假义说要搞斋宴起义冢，得乡绅赞扬。慈突晕倒，诊断出脑有瘀血，需要梅花神针救之，村民筹钱给慈上路找神针传人郡马爷夏侯国栋，栋亦束手无策。
珠知粥店老板陈明乃神针传人，求明救慈，终打动他。
法医宋慈分集介绍第4集 慈终醒来，明劝慈不要放弃生命。
栋得知慈无碍，猜到谁懂得神针。栋揭穿明本是太医，因落药太重令骁骑大将军死亡而成逃犯。慈决为明洗冤，偷偷开棺验尸，少将军马伯豪与栋突出现，慈与龙被捉。慈被逼公开身分，众不信，豪答允给慈五日时间让他的验尸守则手稿送到衙门作印证。慈奇怪栋为何阻止翻案，众感事件另有别情。
杰与坚在驿站遇上送手稿兵士，抢去手稿赶到衙门。明正要为慈落针医病时，栋率众到狱中捉明往处斩，幸手稿至，慈冒头痛写字以证身分。紫霞郡主至，坚称慈乃假冒，幸送稿兵士原来是十皇爷，慈身分得到证实，明终可翻案，但明突然认罪。
法医宋慈分集介绍第5集 慈在验将军尸时发现有芒钉留在尸身，推断有人插赃嫁祸明，真凶终绳之以法。
就在处斩时，霞带同紫龙袍往救之，狂风吹起龙袍，真凶最后难逃天谴。慈留在松山县担任提点刑狱司，珠为替慈取回其妻的玉佩而与宝冲突，凤更间接令宝面部受伤。宝告上衙门，凤被逼入狱三日候判。慈指自己心如止水，叫珠不必对自己太好。宝着龙引见慈，并归还玉佩，慈代凤向宝求情。
公堂上，宝要求凤赔偿一百两。斋宴上凤提出以卖头发筹赔偿金，慈带头捐钱及富翁关万福支持，凤终可赔偿宝。关府发生侍婢跌落井命案，慈调查证实关夫人诬蔑侍婢偷珠钗，侍婢看不开寻死
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