传统教科书将地理信息系统按其内容分为三大类：
(1)专题地理信息系统：是具有有限目标和专业特点的地理信息系统。
(2)区域地理信息系统：主要以区域综合研究和全面信息服务为目标。
(3)地理信息系统工具：它是一组具有图形图像数字化、存储管理、查询检索、分析运算和多种输出等地理信息系统基本功能的软件包。
全国地理信息标准化技术委员会(SAC/TC230)在《地理信息标准体系框架》中将地理信息系统分为：基础地理信息系统、专业应用的地理信息系统和专项应用的地理信息系统。
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