1948年人民解放战争成功期近，蒋介石下号令将故宫博物院的部门贵重文物用军舰转运台湾，先后共运送各类文物6796箱。先存台中市，租借台中市糖厂仓库存放。
1949年8月23日，文物迁进台中县雾峰乡吉峰村，并成立“国立中心博物图书院馆结合治理处”，并于台中县雾峰乡北沟觅地建筑库房（隔年4月落成，文物随即迁进）。11月，战时河南省存放在重庆中心大学柏溪分校的68箱出土文物，亦被运到台中市糖厂仓库存放。
1950年4月，台中郊外雾峰乡吉峰村仓库落成，运台文物随即迁进新库存贮。1951年6月，成立两院存台文物清点委员会，延聘学者、专家为委员，停止重编箱号、抽查箱内文物，曲到1954年才完成。此次清点也体例了《点查清册》，成为存台两院文物的原始清册。
后来在美国中表情报局分收机构自在亚洲协会的帮助下，台湾获得约68.8万元新台币（约合其时4.36万美圆），在1957年1月成立一个占地近600平方米的文物陈列室。
那间简单的文物陈列室，在八年间总计招待过30余万人次，并有伊朗国王巴列维、日本辅弼吉田茂、泰国国王普密蓬、约旦国贵爵赛因、沙特阿拉伯国王沙特‧本‧阿卜杜勒阿齐兹‧阿勒沙特、国际奥委会 布伦达治等名人政要到访，替国民党当局挣足了所谓的“文化外交”体面。
为了国内公众的猎奇，1953年美国积极催促将故宫文物至美国巡回展览。王世杰被指派负责预备展览。
为避免新中国可能会提起扣押文物的诉讼，台湾要求美国赐与豁免权，而美国也痛快地应承下来。就如许，两边一拍即合，故宫文物遂于1961年飘洋过海到了美国，美国总统肯尼迪还亲身担任展览的名望倡导人，足见美国对此事的重视。
展览在美国展出后非常颤动，当台湾诡计修建正式的博物馆收躲故宫文物时，美国再度透过自在亚洲协会供给巨款，处理了当局者的阮囊羞怯窘境。除了建立工程款之外，从北沟文物陈列室期间到台北故宫落成后，美国还援助过大大小小的不等金额，协助台湾拍摄文物照片或出书学术刊物，出手非常大方。
但要重视的是，固然美国那些行动在客看上有保留与促进文化之功，但回根到底仍是带有抵抗新中国的阴谋。
1965年9月20日，台北故宫以“中山博物院”的名义正式成立于台北外双溪，展出自北京故宫携来的部门精品。蒋介石将台北故宫视为弘扬中华文化的象征，因而在建筑式样与内部空间设置装备摆设上，处处力图再现传统宫殿风貌或政治伦理，而非强调博物馆的展览功用。因而，台北故宫将现代式建筑草案舍弃，摘用了宫殿式图样，器字形的内部格局，模仿了《周礼》记载的天子祭奠用明堂。
