如何使用Mega6.3进行分子进化分析？

Mega6.3是一款普遍利用的分子进化阐发软件，具有多种功用和东西，能够用于构建基于DNA、RNA和卵白量序列的进化树、计算分子进化间隔、停止序列比对和模子选择等。下面详细介绍若何利用Mega6.3停止分子进化阐发。

起首需要在Mega网站上下载Mega6.3软件，并根据提醒停止安拆。安拆完成后，翻开软件即可起头利用。

Mega6.3撑持多种序列格局，包罗FASTA、GenBank、EMBL、NEXUS等。能够通过“File”菜单中的“Open Data File”选项或者快速键Ctrl+O来导入序列数据。

Mega6.3供给了多种序列比对东西，包罗ClustalW、MUSCLE、T-Coffee等。能够通过“Align”菜单中的“Multiple Sequence Alignment”选项或者快速键Ctrl+M来翻开序列比对对话框，选择比对东西和参数，停止序列比对。

Mega6.3撑持多种进化树构建办法，包罗邻接法、更大简约法、更大似然法等。能够通过“Phylogeny”菜单中的“Construct/Test Maximum Likelihood Tree”选项或者快速键Ctrl+T来翻开进化树构建对话框，选择进化模子和参数，停止进化树构建。

Mega6.3供给了多种分子进化间隔计算办法，包罗Jukes-Cantor、Kimura 2-parameter、Tamura-Nei等。能够通过“Distance”菜单中的“Compute Pairwise Distances”选项或者快速键Ctrl+D来翻开分子进化间隔计算对话框，选择计算办法和参数，停止分子进化间隔计算。

Mega6.3供给了多种模子选择和评估东西，包罗AIC、BIC、LRT等。能够通过“Models”菜单中的“Model Selection”选项或者快速键Ctrl+G来翻开模子选择对话框，选择模子和参数，停止模子选择和评估。

以上是Mega6.3停止分子进化阐发的根本流程和操做办法，希望对利用者有所帮忙。