我的合法领养儿子在幼儿园被其亲生母亲利用课间带走，之后二人杳无音信，谁的责任?

可以去公安局报案，这个没问题。你既然是合法收养的，那么就拥有孩子的监护权，即使是孩子的亲生母亲，最多也就是有个探视权，无权使孩子脱离你的监护。

当然，你要追究幼儿园的责任比较难，除非你能举证证明幼儿园知道你与孩子的收养关系。