北京崇文门同仁堂和北京崇文门同仁堂中医医院都是北京地区著名的医疗机构，涉及中西医结合、中医、中西结合外科、妇科、中西结合妇产科、儿科、骨伤科、心脑血管内科、肿瘤科等多个专科领域，是北京地区医疗服务的重要组成部分。
同仁堂是中国传统医药行业的知名企业，其成立于1669年，起初只是一家药铺，而现在已经发展为集医疗、保健、药品研发、生产、销售为一体的综合性企业。同仁堂的医院包括北京崇文门同仁堂中医医院、北京同仁堂中医医院、天津同仁堂医院等分院。而北京崇文门同仁堂则是同仁堂集团旗下的一家医院，位于北京市东城区崇文门内大街1号，是一家以中西医结合为主的综合医院，提供多科室的医疗服务。
北京崇文门同仁堂中医医院位于同一地址，是同仁堂集团旗下的一家专业中医医院，成立于1954年。医院以中医为主，注重通过中医治疗帮助患者恢复健康。医院拥有多名中医名家，如王光复、魏东林、杨金富等，注重传统中医和现代医学的结合，不断推进中医现代化进程。
所以，北京崇文门同仁堂是同仁堂集团旗下的一家以中西医结合为主的综合医院，而北京崇文门同仁堂中医医院则是同一地址下的一家专业中医医院，两家医院彼此独立，但都是同仁堂集团的重要组成部分。
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