pcr退火温度如何确定?如何给一段序列增加一个酶切位点?

4天前 (10-16 01:56)阅读2回复0
雕刻瞎
雕刻瞎
  • 管理员
  • 注册排名6
  • 经验值344120
  • 级别管理员
  • 主题68824
  • 回复0
楼主
退火温度=4×(G+C)+2×(A+T)-(5~8) 只是粗算,有时不灵,但比较简便,用primer5计算,引物配对好后,primer5可以显示Tm,我认为这个值就是退火温度,我的经验再加2 or 3度最好,如何给一段序列增加一个酶切位点?经过PCR后引物和目的基因连在一起,酶切位点自然也连上去了,楼主,你可以根据需要,引入不同的限制性内切酶的酶切位点, primerpremier设计引物如何保存?不懂的话继续问, 引物退火温度?
  1. pcr退火温度如何确定?
  2. 如何给一段序列增加一个酶切位点?
  3. primerpremier设计引物如何保存?
  4. 引物退火温度?

pcr退火温度如何确定?

pcr退火温度如何确定?如何给一段序列增加一个酶切位点?

退火温度=4×(G+C)+2×(A+T)-(5~8) 只是粗算,有时不灵,但比较简便。

用primer5(or oligo6)计算,引物配对好后,primer5可以显示Tm,我认为这个值就是退火温度,我的经验再加2 or 3度最好。

如何给一段序列增加一个酶切位点?

你可以设计带有酶切位点的引物,对目的基因进行PCR,就可在目的基因上引入酶切位点。步骤:引物设计(借助软件)——合成引物(公司合成)——PCR。最重要的一个仪器就是PCR仪了,具体的加什么试剂,加多少,我想楼主应该是做分子生物学,这些应该挺清楚的了。楼主,引物一般是用软件设计,例如Primer.5,你根据你的目的基因两端的特点,设计合适的引物,然后在引物上再添加酶切位点 ,例如EcoRⅠ 是应用最广泛的限制性内切酶,酶切位点和切割位点如下: 5' G↓AATTC 3' 3' CTTAA↑G 5' ,你就可以在这两条引物上分别添加这几个脱氧核苷酸,这不就在引物中引入酶切位点了吗?经过PCR后引物和目的基因连在一起,酶切位点自然也连上去了。楼主,你可以根据需要,引入不同的限制性内切酶的酶切位点。

primerpremier设计引物如何保存?

设计好后,点左上角的“edit”,再点“copy”,然后选择正向引物或反向引物,点击后就已经复制到剪切板里了。然后打开word、txt或者exel文件,直接ctrl+V粘贴即可。 ———————————————————————— save to database是存入了PP5自己的数据库中。就像这样: 然后你在下面选中你的引物,点export,就存进了数据库中,然后你可以编辑名字之类的。 不懂的话继续问。

引物退火温度?

Tm指的是把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。我们PCR时候,当然不能用Tm值来作为退火的温度。一般来说,退火温度比Tm值要低上5度左右。但是这个也不是绝对的。建议你如果说模板比较充足的话,做一个梯度试验。范围在Tm值周围10度左右,如果说在这个范围内可以得到一个明显的结果就可以确定。如果说仅仅看到一个趋势,那么你还需要继续扩大这个梯度的范围来确定。

0
回帖

pcr退火温度如何确定?如何给一段序列增加一个酶切位点? 期待您的回复!

取消
载入表情清单……
载入颜色清单……
插入网络图片

取消确定

图片上传中
编辑器信息
提示信息