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福建医科大学具有较早开展卫生治理教学科研与人才培植的历史。1985年即开办卫生干部专修班,1999年成立卫生治理教研室,2001年设立公共事业治理本科专业,2010年6月成立校卫生政策研究中心,2019年2月成立卫生健康研究院。2020年与福建省医疗保障局协作 成立“福建省医疗保障研究院”。为积极响应国家战术需求,服务区域经济社会发展,进1步优化和拓展学科布局,强化公共治理学科建设,2022年6月由卫生健康研究院、公共卫生学院卫生治理学系及卫生法学与卫生政策学系合并成立卫生治理学院。
学院现有卫生治理学系、卫生法学与卫生政策学系、医保治理学系(筹建)、MPA 教诲中心、实验(案例)教学中心。
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