高通量测序手艺的开展使得群体研究在分子层面大大拓展开来，遗传进化和性状联系关系阐发已成为群体研究的热点。但委托测序公司停止数据阐发，使得科研人员对阐发成果的理解不敷深切，频频的沟通让项目周期大大耽误，同时阐发费用也非常高贵。
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下面我们就来简单介绍下基于高通量测序手艺的群体研究中最常用到的三种办法—— 遗传进化阐发、GWAS阐发、BSA阐发，以及若何停止自主阐发。
遗传进化阐发
在差别保存前提下的统一物种会因为天然选择、人工驯化、遗传漂变等构成差别的亚种或亚群，群体遗传进化研究就是用来逃溯息争析那个过程的研究办法。
基于全基因组重测序手艺或其他测序手艺获得某物种天然群体各亚群的基因组信息，得到大量的SNP、InDel、SV和CNV等变异信息，就能够研究群体的 遗传构造、驯化机造、种群汗青以及群体进化动态等生物学问题。
GWAS阐发
全基因组联系关系阐发(genome wide association study, GWAS) 是操纵全基因组范畴内挑选出的高密度分子标识表记标帜对所研究的群体停止扫描, 利用扫描得到的 分子标识表记标帜数据与表型性状之间停止联系关系阐发的办法。
GWAS的呈现为全面、系统地研究基因组学掀开了新的一页, 在医学中已经操纵该办法判定出大量与人类复杂疾病或数量性状相关的遗传变异, 成为研究人类基因组学的关键手段。而在动动物基因组中GWAS也获得了优良的应用效果, 应用GWAS挖掘动动物复杂数量性状基因、为分子育种供给根据已成为基因组学研究的热点。
GWAS相关于传统的操纵遗传图谱做QTL定位有良多优势：
节约时间：无需构建遗传群体，GWAS天然群体或者种量资本能够间接用于联系关系阐发；
定位切确：人工群体因为群体大小限造，重组不敷够，定位区间往往很大，而GWAS利用的天然群体大都颠末长时间、多世代的繁衍，基因组重组足够，联系关系定位准确；
GWAS中表型性状变异丰硕，只要群体足够大，几乎能够涵盖所有的表型性状，因而GWAS 能够联系关系任何性状。而人工群体因为群体遗传布景单一，若是父母本中某些表型不存在就无法定位该性状。
BSA阐发
BSA（Bulked segregation analysis）即混合分组阐发，也称别离群体分组阐发，是指操纵目的性状存在极端表型差别的两个亲本构建别离群体，在子代别离群体中， 拔取两组表型差别极端的个别别离构建混合池 ，连系高通量测序手艺对混合样本测序，比力两组群体在多态位点（SNP）的等位基因频次（AF）能否具有显著差别，定位与目的性状相联系关系的位点并对其停止正文，研究掌握目的性状的基因及其分子机造。
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在农学中，经常会碰到将与性状相关的基因或位点在基因组长进行定位的需求，比拟于操纵遗传图QTL定位，BSA阐发是一种简便又高效的阐发定位办法。
若何实现自主阐发
知其然还要知其所以然，领会、掌握阐发技能，才可能对阐发成果停止有效的操纵，加快科研产出速度，更何况还能 节约数以万计的阐发费用。
为此组学大讲堂造做了群体研究系列视频课程：《群体遗传进化阐发》、《GWAS全基因组联系关系阐发》、《BSA性状联系关系阐发》、《基因组重测序数据阐发实操》、《群体研究合辑》，课程中办法均提炼自高分期刊已颁发权势巨子文献，供给全数阐发代码及示例数据。习得之后即可对本身的群体测序数据停止阐发，阐发所得图片可间接用于颁发。 该系列课程在各平台累计销量已超2800份！
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