如何利用R软件进行聚类分析?聚类分析可分为Q型聚类和R型聚类,请问Q和R这两个字母的含义是什么,为什么叫Q和R而不叫其他的字母?

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路人甲
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如何利用R软件进行聚类分析?

1、打开R软件,输进数据,生成距离结构。这里设样本数据为1,2,3,7,8,9,15。输进代码:x=c(1,2,3,7,8,9,15);dim(x)=c(7,1);d=dist(x)其中x是生成向量,dim表达 定义向量的维数,dist表达 生成距离矩阵。

如何利用R软件进行聚类分析?聚类分析可分为Q型聚类和R型聚类,请问Q和R这两个字母的含义是什么,为什么喊Q和R而不喊其他的字母?

2、生成系统聚类。输进代码:hc1=hclust(d,"single");hc2=hclust(d,"complete");hc3=hclust(d,"median");hc4=hclust(d,"average");其中hclust表达 系统聚类计算函数,single、complete、median、average各表达 最短距离法、最长距离法、中间距离法、类平均法这4类计算方法。

如何利用R软件进行聚类分析?聚类分析可分为Q型聚类和R型聚类,请问Q和R这两个字母的含义是什么,为什么喊Q和R而不喊其他的字母?

3、绘制出聚类图形。利用plot函数绘制出最短距离法计算的聚类图。代码:plot(hc1)

如何利用R软件进行聚类分析?聚类分析可分为Q型聚类和R型聚类,请问Q和R这两个字母的含义是什么,为什么喊Q和R而不喊其他的字母?

4、为了方便比较各聚类方法的效果,可以将不同方法的图绘制在1张图上。输进代码:opar=par(mfrow=c(2,2))plot(hc1,hang=-1);plot(hc2,hang=-1);plot(hc3,hang=-1);plot(hc4,hang=-1);par(opar)其中par为绘图参数函数。mfrow为设置小图数量的参数,mfrow=c(2,2)表达 把图按行排列成2×2个小图。画出的图形见下图。

5、从图中可以看出聚类的结果为第1,2,3个值为1类,4,5,6个值为1类,第7个值为1类。共分为3类。如果想自动设置分类个数,可以利用函数rect.hclust。plot(hc1);re=rect.hclust(hc1,k=2)表达 将聚类图分为两类。

聚类分析可分为Q型聚类和R型聚类,请问Q和R这两个字母的含义是什么,为什么喊Q和R而不喊其他的字母?

在聚类分析中,一般我们将依据分类对象的不同分为Q型聚类分析和R型聚类分析两大类。

R型聚类分析是对变量进行分类处理,Q型聚类分析是对样本进行分类处理。R型聚类分析的主要作用是:

1、不但可以了解个别变量之间的关系的亲疏程度,而且可以了解各个变量组合之间的亲疏程度。

2、依据变量的分类结果以及它们之间的关系,可以抉择主要变量进行回回分析或Q型聚类分析。Q型聚类分析的优点是:

1、可以综合利用多个变量的信息对样本进行分类;

2、分类结果是直看的,聚类谱系图非常清楚地表现其数值分类结果;

3、聚类分析所得到的结果比世代相传分类方法更细致、全面、合理。为了进行聚类分析,首先我们需要定义样品间的距离。 常见的距离有 :

① 绝对值距离 ② 欧氏距离 ③ 明科夫斯基距离 ④ 切比雪夫距离

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