中药化学(成分)指纹图谱是指确定中药中含有多种化学成分(次生代谢物)的指纹图谱，虽然化学成分是次生代谢产物，受生物环境和生长寿命的影响，但植物代谢是遗传的，作为同一物种的个体在化学成分上也有相似之处(similarity)，指纹图谱可以用化学成分的谱图建立。 中药化学指纹图谱主要包括光谱法和色谱法，如紫外线光谱法(UV)、红外光谱(IR)、质谱(MS)、核磁共振谱(NMR)，薄层色谱(TLC)、气相色谱(GC)、高效液相色谱(HPLC)、毛细管电泳(CE)，以及各种应用技术。 中药化学指纹图谱对控制中药质量具有更直接、更重要的意义。
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