1、USB Key是USB接口的硬件设备，它内置单片机或智能卡芯片，具有一定存储空间，可以存储用户的私钥和数字证书，使用USB Key内置公钥算法实现对用户身份的认证。
USB-HDD是硬盘模拟模式，DOS启动后显示C盘，是由U盘格式化工具制成的U盘采用此启动模式，这种模式具有很高的兼容性，但不能启动一些只支持USB-ZIP模式的计算机。
USB Key主要应用于个人隐私保护和电子支付等领域；而USB-HDD主要用于存放文件，尤其适合办公环境和移动设备等。
2、为了进一步解释这两种不同类型的U盘，还有一些其他的启动模式，
- USB-ZIP：这是大容量软盘模拟模式，DOS启动后显示A盘，FlashBot制作的USB-ZIP启动U盘采用此模式，这种模式对于一些老电脑或者只有少量存储空间的老电脑来说，是一个不错的选择，因为它能将大部分有用的文件放在一个易于访问的地方，而不是堆积在一起，对于很多现代电脑来说，这种模式的U盘的兼容性和性能都无法满足要求。
- USB-HDD+：这是USB-HDD的一种扩展方式，DOS启动后，它可以改变为USB-ZIP模式，这样，如果想要让所有安装了Windows操作系统的计算机都能使用这个U盘，就可以将其设置为USB-HDD+模式，这对于很多新的和旧的计算机来说都是非常实用的功能，如果所有的计算机都安装了Windows操作系统，并且都是通过USB-ZIP模式连接到同一个网络上，那么就无法正常工作了。
- USB-ZIP+：这是一种非常强大的USB接口模式，支持USB-HDD/USB-ZIP双模式启动，通过这种方式，就可以让所有的计算机都能够从USB-HDD开始工作，并且可以通过USB-ZIP来传输文件，这种模式对于那些经常进行多任务处理的计算机来说是非常重要的，因为它们不需要每次都需要通过USB-ZIP来启动一个新的任务。
USB Key和USB Hard Disk的主要区别在于它们的功能和用途，USB Key适用于个人隐私保护和电子支付等领域，而USB-HDD则主要用于存放文件，特别适合办公室环境和移动设备等，除了这些基本功能外，还有其他的USB接口模式可以用来解决不同的问题。